ITA mantiene acuerdos con socios estratégicos con instituciones prestigiosas del Perú y del mundo:
- ACEER - Centro Amazónico para la Educación Ambiental y la Investigación
Organización sin fines de lucro fundada en 1991 cuya misión es promover la conservación y el medioambiente y fomentar conciencia y comprensión.
- IFC - Corporación Financiera Internacional
La Organización del Banco Mundial brinda apoyo a ITA para la conservación del bosque amazónico en RESERVA AMAZONICA.
- AMARENAMAD - Asociación para el Manejo de los Recursos Naturales de Madre de Dios
Desarrollo de actividades de investigación y planificación del uso sostenible de la fauna silvestre en el territorio de las comunidades del bajo Madre de Dios.
- Conservación International - Peru
Esta organización desarrolla proyectos en 23 países con el fin de proteger los ecosistemas en peligro de extinción. Uno de estos territorios es el área protegida de la Reserva Nacional de Tambopata y el Parque Nacional Bahuaja Sonene.
- Missouri Botanical Garden (U.S.)
Identificación y publicación de la diversidad de flora de Machu Picchu y Tambopata (Madre de Dios).
- National Geographic Society (U.S.)
Investigación y divulgación de la riqueza cultural y natural de Machu Picchu.
- Universidad Nacional de San Marcos, Museo de Historia Natural
Investigación científica de la flora y fauna de la amazonía peruana.
- Bear Rescue Foundation (UK) - Apoyo en el programa de conservación del Oso de Anteojos.
- CENFOTUR - Centro de Formación en Turismo (CENFOTUR, Perú).
- FADEMAD - Federación de Agricultores de Madre de Dios (Peru).
